小智等人没想到他们又卷入了一场大危机中！
明明只是因为没有赶上一周一趟的长途汽车而被困在了清澈崖下，却因为火箭队的原因皮卡丘被抓走，紧接着又出现了新的火箭队的精英成员！
那个黄头发的漂亮女性隐藏在他们之中，没想到居然是火箭队的人！
朵米诺！
比起武藏小次郎喵喵更专业的，邪恶组织成员！
然后，小智等人就被打飞到了湖的边缘。
火箭队三人组则带着皮卡丘飞到了湖中心的小岛上！
小智无法冷静，必须要去拯救皮卡丘！
就在这时......
周围，无数战斗运输机从清澈崖的四面八方飞了起来，冲向清澈崖内部。
那火箭队等人和皮卡丘所在的小岛上！
......
“我必须去救皮卡丘！”小智说道。
他看向那湖中心的小岛。
他知道，皮卡丘就在那里！
他必须去！
“可是，我们要怎么过去呢？”小霞看着这超大的湖泊，有些为难。
她自然而然地开始为小智考虑了。
调查清澈崖环境，住在清澈崖下的自然学家，露娜指着旁边的大树说道：“或许，可以用来做独木船。”
小智没有犹豫，直接扔出两颗精灵球：“出来吧妙蛙**，月桂叶，使出飞叶快刀！”
不得不说，小智的宝可梦艺术细胞都很强大，就像当初喷火龙可以用喷射火焰来完成冰船一样，现在他们轻松地就做出了独木船。
小智小刚小霞露娜以及医学博士贝尼斯里纳全部上船，向着湖中小岛划去。
可就在这时......
那天空中，原本停留的运输机，突然对小岛发动了攻击！
原本坂木的计划是在清晨的时候开始发动攻击，可因为凶介的原因，让他以为联盟已经到达了清澈崖附近，迫使他不得不加快了计划的实施。
不再等待，直接进入正题！
导弹发射。
在夜空划出明亮流星。
直指小岛！
“皮卡丘！”小智心痛大喊道！
皮卡丘还在岛上啊！
可是，他的力量却无法阻止这一切的发生！
好在......
有其他的力量来阻止！
一层紫色的薄膜将湖中小岛包裹住了。
那些导弹，在接触到薄膜的时候发生爆炸，可却连掀起一点波澜都做不到。
“什么情况？”小智的疑惑脱口而出。
可没人能够告诉他答案。
整个独木船都停止在了水面，每个人都忘记了划船。
等到导弹爆炸的烟幕散去后，终于，一个人影出现在了小智等人的面前！
不，那并非是人类。
那空中的，粉色的人型生物，应该是宝可梦。
未知的宝可梦！
它就这样，飞在天空中。
小智能够感觉到，那神秘的，未知的宝可梦，看了他一眼。
那眼中，有很多说不清道不明的东西。
当这只宝可梦现身的时候，运输机的攻击也停止了。
它们慢慢地，围了上来。
将那宝可梦，和湖中小岛一起围了起来。
神秘宝可梦警惕地看着周围。
可不知为何，并未直接动手。
它的正前方，运输机顶部突然打开来。
高台升起。
上面，一个人影正抓着栏杆，看着它。
“梦幻二号。”坂木微笑地，亲切地打着招呼。
梦幻二号？这是那只宝可梦的名字吗？为什么这么奇怪？下方的小智想着。